9 листопада зразок sars-cov-2 був узятий у інфікованого пацієнта в ботсвані. Геномний аналіз швидко показав, що цей зразок являє собою новий варіант, спочатку названий b. 1.1.529.
Вчені з південної африки швидко простежили з’являється варіант в ряді місцевих провінцій. Про це було офіційно повідомлено всесвітньої організації охорони здоров’я 24 листопада, а через два дні технічна консультативна група вооз з еволюції вірусу sars-cov-2 ( tag-ve) офіційно назвала b. 1.1.529 “варіантом, що викликає занепокоєння“ (voc), вища категорія небезпеки для розвивається варіанту коронавірусу.
Тоді йому було офіційно присвоєно назву “омікрон“.
Чому він називається омікрон?
На ранньому етапі пандемії вооз визнала необхідність простого способу передачі інформації про нові варіанти sars-cov-2, тому було вирішено, що нові варіанти будуть названі на честь букв грецького алфавіту. Назви присвоюються tag-ve, незалежною консультативною групою, яка оцінює, чи варіант має значення для глобального громадського здоров’я.
Найостаннішим варіантом, на якому була запропонована буква алфавіту, був мю в кінці серпня.
Що сталося з ню і ксі?
Омікрон-тринадцятий варіант sars-cov-2, який отримав офіційне позначення вооз, але позначений 15-ю літерою грецького алфавіту. У заяві вооз вказується, що вона вирішила пропустити ню і ксі, 13-ю і 14-ю букви грецького алфавіту, в результаті чого ми підійшли до омікрон як до останнього варіанту маркування.
” дві букви були пропущені, тому що ню занадто легко сплутати з “нью“ – “новим“, а ксі не використовувався, тому що вона співзвучна з китайським прізвищем xi і передові методи вооз для позначення нових хвороб (розроблені спільно з фао і меб ще в 2015 р. ) пропонують уникати ” образ будь-яких культурних, соціальних, національних, регіональних, професійних або етнічних груп“, – йдеться в недавній заяві вооз.
Чому омікрон викликає таке занепокоєння?
Найбільший червоний прапор навколо omicron – це величезна кількість мутацій, накопичених цим варіантом. Вінод баласубраманіам, вірусолог з університету монаша в малайзії, каже, що всі мутації, що спостерігаються в омікрон, відбуваються в регіонах, які ми раніше пов’язували з підвищеною трансмісивністю і захистом від імунітету.
“у спайковому білку b. 1.1529 є 32 мутації“, – пояснює баласубраманіам. “до них відносяться e484a, k417n і n440k, які допомагають вірусу уникнути виявлення антитілами. Інша мутація, n501y, здається, збільшує здатність вірусу проникати в наші клітини, роблячи його більш переданим. Ще один важливий момент, який слід зазначити, полягає в тому, що більшість основних мутацій розташовані в rbd [рецептор-зв’язуючий домен] білка-шипа, точному місці, де антитіла від вакцин зв’язуються / націлені, іншими словами, 32 мутації, виявлені в спайк-білок нового варіанту змінить форму цієї структури, що зробить її проблематичною для імунної відповіді, викликаної вакцинами“.
деякі з визначальних мутацій між різними варіантами sars-cov – 2 є загальними, в той час як багато з них є новими для омікрон covariants.org
Ще занадто рано розуміти реальний вплив омікрону, але цей варіант був пов’язаний з серйозним сплеском випадків covid-19 в провінції гаутенг в південній африці. Показники позитивності (кількість проведених тестів по відношенню до кількості виявлених позитивних випадків) в цьому регіоні різко зросли з 1 до 30 відсотків за останні два тижні.
Лікарі в тих регіонах, де з’являється омікрон, поки що відзначили, що цей варіант викликає тільки легке захворювання. Але ці початкові інфекції були виявлені в основному у більш молодого населення, яке, як правило, відчуває тільки легку форму covid-19, тому ще належить визначити, чи викликає омікрон більш важке захворювання.
Звідки з’явився омікрон?
Особливо незвичайним аспектом появи омікрон є його дивно ізольоване геномне походження. Повне переважання варіанту дельта за останні шість місяців змусило багатьох вчених передбачити, що будь-яке майбутнє, що стосується варіантів, “майже напевно“ буде відбуватися з дельти.
Однак тревор бедфорд, дослідник, який вивчає еволюцію вірусів, говорить, що омікрон не вийшов з недавнього варіанту. Фактично, здається, що найближчим еволюційним зв’язком omicron є штам sars-cov-2 з середини 2020 року.
” ця надзвичайно довга гілка (>1 року) вказує на тривалий період звернення в географії з поганим геномним наглядом (звичайно, не в південній африці) або на безперервну еволюцію у хронічно інфікованої людини перед тим, як повернутися назад в популяцію“, – пояснює бедфорд в twitter.
Чому це відрізняється від попередніх позначень варіантів?
Що відрізняє поява омікрон від раніше виявлених варіантів sars-cov-2, так це раннє його виявлення. Варіант дельта був вперше задокументований ще в жовтні 2020 року, перш ніж викликав інтерес у квітні 2021 року і, в кінцевому підсумку, отримав маркування voc в травні після того, як вчені пов’язали його з масовим сплеском в індії.
Альфа (спочатку називалася британським варіантом) випробувала аналогічну траєкторію: між попереднім виявленням і визначенням пройшли місяці. В обох випадках світ не відразу помітив поширення небезпечного варіанту sars-cov-2.
У випадку з омікрон через надзвичайно надійну систему геномного нагляду в південній африці був виявлений новий і незвичайний варіант sars-cov-2, перш ніж він значно поширився по світу. На жаль, це також означає, що зараз немає хороших відповідей на питання, що стосуються трансмісивності омікрона або серйозності захворювання.
Нагадаємо, раніше повідомлялося, що .
